Xbox Commander es un programa avanzado pero fácil de usar para navegar por su Xbox, servidor FTP o unidades de ordenador, ya sean disqueteras, discos duros, unidades de CD, unidades de DVD o unidades de red. El programa permite crear una copia de seguridad de cualquier directorio de sus unidades de disco duro en formato Xbox ISO (xIso). Estos archivos ISO de Xbox pueden ser respaldados en un CD o DVD. Cualquier archivo ISO de Xbox descargado o creado puede ser extraído a la Xbox.
Además, el programa puede cargar/descargar cualquier archivo o directorio desde el ordenador a la Xbox o al servidor FTP. Esto permite subir el contenido de la ISO de la Xbox a velocidades de hasta 11 MB por segundo. La configuración del usuario de la versión 4.1 se almacena en la carpeta Documents & Settings del propio usuario en lugar de la carpeta de archivos del programa.